胃內的幽門螺旋桿菌依靠其高活性的內源性尿素酶能將口服的碳標記的尿素分解成氨氣和C標記的二氧化碳，后者極易彌散入血，經(jīng)肺呼出而被檢測到。幽門螺旋桿菌測定儀的原理樣品卡上的放射性核素衰變產生的β射線到達儀器探測器后，生成電信號，經(jīng)電子線路和單片機進行比較后，根據(jù)所設定的判斷閾值，給出樣品的診斷結果（陰性、陽性或不確定），儀器同時顯示和自動打印這一結果。因此通過儀器測量呼氣中C標記的二氧化碳含量，即可判斷胃內Hp  。

呼吸卡的工作原理：該裝置被稱為呼氣卡, 幽門螺旋桿菌測定儀的原理由吸附有堿性物質的CO2 吸收片和承載此吸收片的框架組成?？蚣苤杏袣獾朗沟煤魵饽芙?jīng)氣道到達吸收片，且其中的CO2吸收片中的化學吸收劑吸收?？蚣軆蓚乳_有窗口，吸收片中發(fā)出的β射線通過窗口射向探頭。此外呼氣卡還設置一個 CO2 吸收量小指示窗，幽門螺旋桿菌測定儀的原理通過指示劑變色情況來確定CO2的吸收量，這樣在集氣完成后，呼氣卡便吸收有固定量的CO2 ，從而可以測定C標記在呼出CO2中的比活度。 

還有另一種類似的檢測方法，C呼氣試驗。兩者的原理是一樣的，只是C有少量的放射性，幽門螺旋桿菌測定儀的原理輻射量相當于坐一次飛機，長期的**已證實對人體無害，但暫不建議孕婦和兒童做該項檢查，而C呼氣試驗沒有放射性，是穩(wěn)定性核素，但費用較C 高。